Masjid Besar Mujahidin Majenang menyediakan beragam fasilitas yang dapat dinikmati jamaah selama berada di dalam masjid. Selain itu, terdapat gerai-gerai yang melengkapi fasilitas di Masjid Besar Mujahidin.
Fasilitas:
- Tempat wudu serta toilet putra dan putri yang ramah bagi penyandang disabilitas
- Penitipan sepatu, sandal, dan tas secara gratis (di sayap utara dan timur Ruang Utama)
- Alat salat yang dapat dipinjamkan di lantai bawah (pakaian untuk pria) dan lantai atas (mukena untuk wanita)
- Alquran yang dapat dibaca di dalam masjid
- Air minum gratis di pintu masuk barat, didukung oleh
- Listrik gratis melalui stopkontak di berbagai titik di masjid
- Kamera CCTV di berbagai sudut untuk menunjang keamanan masjid
- Perpustakaan mini di timur Ruang Utama
- Menara pandang untuk melihat pemandangan Majenang
- Parkir sepeda motor dan mobil yang luas di sisi barat dan timur masjid dan halaman dalam masjid